TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/20.500.14627/9
Browse
4 results
Search Results
Article Bir Tiyoeter-triazol Hibriti: Güçlü Metap2 Inhibitörü ve Prostat Kanseri için In Vivo Tümör Baskılayıcı Bileşiğin In Silico Çalışmaları ve In Vitro Mikrozomal Metabolizması(2023) Coşkun, Göknil Pelin; Ulgen, Mert; Birgül, Kaan; Evren, Asaf Evrim; Küçükgüzel, Ş.günizArka plan/amaç: Antikanser bir ilaç adayı bileşik olan ( S)-3-((2,4,6-trimetilfenil)tiyo)-4-(4-florofenil)-5-(1-(6-metoksinaftalen-2-)il) etil)-4H-1,2,4-triazol (SGK636), bileşiğinin in vitro mikrozomal metabolizması çalışılmış ve potansiyel S-oksidasyon ve S-dealkilasyon metabolitlerini belirlemek için NADPH ile güçlendirilmiş domuz mikrozomal preparatları kullanılarak incelenmiştir. Gereç ve Yöntemler: Bu çalışmada, sülfoksit metaboliti kromatografik ve spektroskopik yöntemlerle sentezlenmiş, saflaştırılmış ve karakterize edilmiştir. SGK636, S-oksidasyon ve S-dealkilasyon metabolitleri daha sonra ters fazlı bir LC-MS, UV spektroskopisi ve bir HP-TLC sistemi ile ayrılmıştır. In vitro mikrozomal metabolik deneylerin sonuçları, SGK636’nın, aynı Rt ve Rfx100 değerleri ve UV/ ile LC-MS, LC-MS/MS ve HP-TLC tarafından gözlemlenen karşılık gelen S-oksidasyon metabolitini (sülfoksit) ürettiğini göstermiştir. Otantik bileşiklerle karşılaştırıldığında MS spektrumlarında, herhangi bir S-dealkilasyon metaboliti tespit edilmemiştir. Bulgular: Mevcut sonuçlar moleküler doking ve moleküler dinamik çalışmalarla kanıtlanmıştır. Sülfoksidasyon işlemi tersine çevrilebilir olduğundan ve deneyimizdeki düşük miktarda sülfoksit metabolitini kısmen açıklayabildiğinden, sülfoksit bileşiği de inkübe edilmiştir. Substrata (SGK636) geri dönüşüm gözlenmemiş olup, karşılık gelen sülfon metabolitinin oluştuğu gözlenmiştir. SGK636’nın otooksidize olup olmadığını belirlemek için substrat ayrıca standart inkübasyon koşulları altında tampon içinde inkübe edilmiştir, ancak karşılık gelen sülfoksitte herhangi bir oto-oksidasyon gözlenmemiştir. Sülfona herhangi bir olası otooksidasyonu veya tekrar SGK636’ya indirgemeyi görmek için tampondaki SGK636-SO (sülfoksit) için bir stabilite çalışması da yapılmıştır. Her iki şekilde de dönüşüm gözlemlenmemiştir. Substrat, farmakolojik aktivitesi açısından bir avantaj olabilecek metabolik reaksiyonlara ve otooksidasyona karşı kararlı görünmektedir. Sonuç: Mevcut metabolik çalışma, SGK 636’nın S-oksidasyonuna uğradığını göstermektedir. Sorumlu oksidatif enzimi belirlemek için moleküler yerleştirme ve moleküler dinamik çalışmalar yapılmıştır. CYP3A4’ün S-oksidasyonundan sorumlu enzim olduğu bulunmuştur.Research Project Yeşil Kimya Teknikleri ve Moleküler Docking Yöntemleri ile Yeni Florokinolon Hibrit Moleküllerin Sentezi, Dna Giraz, Topoizomeraz Iv İnhibisyonu ve Antibakteriyel Aktivitelerinin Araştırılması(2021) Durukan, İnci; Kulabaş, Necla; Akdemir, Atilla; Faiz, Özlem; Ayvaz, Aslıhan; Kilic, Ali Osman; Demirbaş, Ahmet; Azafad, İmaneBu projede öncelikle, literatür verilerinden ve grubumuzun daha önceki çalışmalardan elde ettikleri sonuçlara (yapı-aktivite ilişkileri, SAR) dayanılarak DNA giraz ve topoizomeraz IV inhibisyonu göstermesi öngörülen ve florokinolon-heterohalka hibrit bileşikleri içeren sanal veribankası oluşturulmuştur. Daha sonra bu veribankasından ön çalışmalarımızda geliştirdiğimiz ve valide ettiğimiz sanal tarama yöntemleri ile E. coli veya S. aureas DNA giraz veya DNA topoizomeraz IV enzimlerini inhibe etme potansiyeline sahip olan 75 bileşik sentez için önerilmiştir. Sentezlenen bütün bileşikler enzim inhibisyonu ve antimikrobial aktivite deneylerinde test edilmiştir. Sentezlenen bileşiklerin bazılarının giraz ve topoizomeraz IV inhibisyonu göstermemesine karşılık bilinen antibakteriyel ilaçlar olan norfloksazin, siprofloksazin kadar veya onlara yakın derecede antibakteriyel aktivite göstermesi, bunların florokinolon antibiyotiklerinden farklı bir mekanizma üzerinden etki ettiklerini göstermektedir ki bu durum özellikle ilaç direnci probleminin üstesinden gelme çalışmalarına katkı sağlama potansiyeli göstermektedir. Sentez çalışmalarında geleneksel ısıtma veya karıştırma yöntemlerine ilaveten mikrodalga veya ultrasonik ışınlandırma tekniklerinin de denenmiş ve geleneksel yöntemlere üstünlük sağlayan sonuçların elde edilmiş olması, bu çalışmayı yeşil kimya tekniklerinin geliştirilmesi açısından da değerli kılmaktadır.Article Citation - Scopus: 2Synthesis and Biological Evaluation of Novel Paracetamol-Triazole Conjugates(Society of Pharmaceutical Sciences of Ankara (FABAD), 2023) Kulabaş, Necla; Gurboga, Merve; Özakpınar, Özlem Bingöl; Liu, Jianyang; Jakobson, Per-johan; Danış, Özkan; Küçükgüzel, İlkay; Jakobsson, Per-Johan; Ogan, AyseBaşlangıç maddesi olarak parasetamol kullanılarak bazı yeni triazol içeren asetamid türevleri 9-20 sentezlendi ve yapıları FTIR, NMR (1H and 13C) ve kütle spektral verileri ile karakterize edildi. Beş insan kanser hücre hattına (akciğer kanseri A549, kronik miyelojenöz lösemi K562, meme kanseri MCF-7, prostat kanseri PC-3, nöroblastoma SH-SY5Y hücre hatları) karşı sentezlenen tüm moleküllerin in vitro sitotoksik aktiviteleri incelendi ve ayrıca seçiciliği tanımlamak için fare embriyonik fibroblast hücreleri (NIH/3T3) üzerinde sitotoksik etkileri MTT yöntemiyle test edildi. Ek olarak, on iki hedef bileşik 9-20, mPGES-1 ve COX-1/2 inhibe edici etkileri açısından tarandı. Sentezlenen bileşiklerin hiçbiri hem kanser hücrelerine hem de mPGES-1 ve COX-1/2 enzimlerine karşı anlamlı bir inhibisyon göstermezken, sağlıklı hücrelere karşı da sitotoksik olmadıkları belirlendi. Son olarak yeni sentezlenen bileşiklerin ADMET özellikleri in siliko yöntemler kullanılarak tahmin edildi.Article Citation - Scopus: 3Therapeutic Effects of Momordica Charantia L. Ethanolic Extract on Acetic Acid-Induced Ulcerative Colitis in Rats(Istanbul University Press, 2021) Ozbeyli, D.; Sen, A.; Aykac, A.; Terali, K.; Cilingir-Kaya, O.T.; Senkardes, I.; Sener, G.Objective: This study aims to investigate the effect of Momordica charantia L. (MoC) ethanolic extract on ulcerative colitis (UC) and was explored in vitro and in vivo. Materials and Methods: The rats were divided into control (C), saline-treated colitis (AA), MoC extract-treated colitis (AA+MoC), and sulfasalazine (SS)-treated colitis (AA+SS) groups. Colitis was induced by acetic acid. MoC extract, SS or saline were given to the related groups for 3 days. Interleukine-1β, malondialdehyde, glutathione levels, myeloperoxidase activity, bax/bcl-2 ratio, caspase-9 and caspase-3 levels were measured in colon and macroscopic and histopathologic examinations were done. Total phenolic/flavonoid content and biological activity of MoC were evaluated by in vitro analysis. Results: Compared to the control group, with acetic acid application interleukin-1β levels, myeloperoxidase activity, malondialdehyde levels, bax/bcl-2 ratio, caspase-9 and caspase-3 levels were significantly upregulated, while glutathione levels were significantly decreased in the AA group. In contrast, MoC and SS treatments reduced interleukin-1β, malondialdehyde levels, myeloperoxidase activity, bax/bcl-2 ratio, and caspase-9 and caspase-3 levels. Glutathione levels increased upon MoC or SS treatment. Increased macroscopic and microscopic scoring with AA improved with MoC or SS treatment, but the MoC or SS treated groups had higher score values than the control. Also, in vitro results showed that MoC exhibited 2,2-diphenyl-1- picrylhydrazyl and 2,2'-azino-bis-3-ethylbenzothiazoline-6-sulfonic acid radical scavenging activity as well as significant antilipoxygenase activity. In addition, MoC extract showed a potent anti-inflammatory activity compared to standard indomethacin. Conclusion: Our biochemical, in vitro and histopathologic analysis indicate that MoC is likely to prove beneficial in UC therapy. © 2021 European Journal of Biology. All rights reserved.